1、有针对性，适应性强
企业定制化实施的信息系统由专门的软件开发公司为其量身定制，充分发挥了企业个性化的优势，根据企业对不同的经营理念、管理方针和业务流程的需求，不仅要立足于现状，还要在推动管理变革的基础上超越现状。从而使软件定制具有很强的操作性和应用针对性。尤其是企业管理中的特殊之处，再加上自定义软件开发都要经过细致的系统分析，同时需要针对不同企业的情况，开发出适合于该企业使用的程序，以及将管理者新的管理思想或科学的管理模式融入到软件数学模型中，极大地提高了软件的科学价值，为企业带来巨大的经济效益。
2、使用方便，操作方便
软件定制开发是指根据企业的需要，在经过面向使用者的需求研究之后，再进行专门的开发，再加上自定义软件完全是按照企业现有的工作流程编制的程序，因此，系统功能条理清楚，结构严谨，简单易行，面向员工的操作界面，使用非常方便，为企业节省了很多软件操作的培训费用和培训时间。
3、减少企业培训，促进企业内部管理
由于是在企业信息化初期，信息化供应商根据企业需求进行系统定制开发，满足了企业当前信息化建设的需要和管理要求，但在软件开发公司与企业沟通过程中，企业也会从软件开发公司那里学到自己在其他企业实施类似信息化的先进经验和管理方法，不断改造自己的企业信息系统，不断提高企业的管理能力，同时也解决了企业内部缺乏信息化实施顾问，无法提高企业信息化能力的难题。
4、加快提升管理
由于软件的功能涵盖了各个行业、各个发展阶段和不同规模的企业，因而产品开发周期长，应用难度大，产品升级换代慢，而软件定制开发则可以根据企业所属行业、发展时期和企业规模的变化进行调整。但自定义软件开发公司会不断地提升软件系统，不断地为企业提升管理能力以求生存，因此对企业来说是一种外来的推动，将企业的管理不断地提升。
5、利用率高，价格低廉
通用版软件包括各行各业的多种管理模式和多种功能，但是，对企业来说，不可能全部使用，而且一旦大量裁剪和设置之后，有些特定企业只使用通用版软件中的一小部分。
当企业发展到一定程度，信息系统在使用过程中感觉到某些功能不适合企业自身的发展需要，或想要添加一些功能模块时，通用版软件就会变得难以进行修改，因为软件开发公司不会为某一家企业修改自己的主打产品，这一点也并非小数。但是自定义软件并没有这些困难，所以从长远来看，自定义软件的成本要比通用版软件低。
